水是微生物存在的天然环境，大多数微生物生活在有水的环境中，离开水微生物失去活性甚至死亡，干燥的食物可以保存得更久就是这个道理。水中微生物可分为病毒、细菌、原生动物、部分寄生虫以及部分藻类，其中大多数微生物都可以引起人类的各种疾病。当 的温度达到100℃时，绝大部分水中微生物即死亡或失去活性。由于中国人有喝开水的良好习惯，使得中国人得水传疾病的机会大大降低。
一、 病毒引发的疾病
1、 病毒的属性
病毒是一种体积极微小的微生物，个体尺寸10～300nm（纳米），大多用电子显微镜才能看到。病毒结构简单，属于非细胞型微生物，可以是一种蛋白组成外壳加上几百上千个核苷酸或核酸（如类病毒），或只含有蛋白质（朊病毒）。病毒游离于细胞之外时，不能复制，不表现生命流行性，只以一种有机物的物质形式存在。病毒一旦进入细胞后，它可以控制细胞，使其听从病毒生命活动需要，靠寄生虫在其他生物的活细胞内生长繁殖。病毒最明显的特点是极其“自私”，复制原料和能量全部来自它所寄生的细胞，并使细胞产生病变。
2、 病毒感染
病毒在自然界中分布很广，人、动物、昆虫、植物、真菌、细菌等都可被病毒寄生而引起感染。在人类的传染病中，由病毒感染引起的约占3/4，远远高于细菌和其他微生物所致疾病，如流行性感冒、肝炎、流行性出血热、水痘、带状疱疹以及艾滋病等，传染性强，流行广泛。病毒还与某些肿瘤、先天性畸形、老年痴呆等有关。
病毒有很多种类，按宿主不同可分为生物病毒、植物病毒、细菌病毒；按临床和感染途径可分为呼吸道感染病毒、消化道感染病毒、肝炎病毒、乙脑病毒、神经病毒、性传播病毒等。不同的病毒浸入人体后的扩散方式和致病特点也不一样，有的只引起局部感染，有的可随血液或神经播散。
3、 水传疾病病毒
引发水传疾病的病毒主要有肠病毒，其中脊髓灰质炎病毒，可导致脊髓灰质炎，也叫小儿麻痹症柯萨奇甲型，乙型病毒和埃可病毒，可导致无菌性脑膜炎；其他类型肠病毒，可导致大脑炎。此外，呼吸道肠道弧病毒和腺病毒可导致上呼吸道及肠胃病，轮状病毒和肠胃病毒可导致肠胃炎，甲型肝炎病毒可导致传染性肝炎等。
目前已知由病毒引起的介水传播疾病有甲型肝炎、病毒性肠胃炎等。据美国的调查统计，1971～1985年水传播疾病中，甲型肝炎爆发过23次，发病人数737人；病毒性肠胃炎爆发过20次，发病人数多达6254人，小儿麻痹症爆发过1次，发病人数16人。
二、 细菌引发的疾病
1、 细菌的属性
细菌是属于原核型细胞的一种单胞生物，形体微小，结构简单，无成形细胞核、也无核仁和核膜，除核蛋白体外无其他细胞器。细菌在适宜的条件下有其相对稳定的形态与结构，按其外形主要有三类，球菌、杆菌和螺形菌。细菌的结构按分布部位大致可分为：表层结构，包括细胞壁、细胞膜、荚膜；内部结构包括细胞浆、核蛋白体、核质、质粒及芽胞等；外部附件，包括鞭毛和菌毛。细菌具有独立的生命活动能力，可从外界环境中摄取营养物质，获得能量，具有代谢旺盛、繁殖迅速的特点。细菌代谢过程中，可产生多种对人类的生活有重要意义的代谢产物，致病细菌则导致人类疾病。
2、 水中的细菌及检测
水中的细菌来自土壤、尘埃、污水、人畜排泄物及垃圾等。水中细菌种类及数量因水源不同而异。一般地面水比地下水含菌数量多，并易被病原菌污染。在自然界中，水源虽不断受到污染，但也进行着自净作用。日光及紫外线可使表面水中的细菌死亡，水中原生生物可以吞噬细菌，藻类和噬菌体能抑制一些细菌生长；另外水中的细菌常随一些颗粒下沉于水底污泥中，使水中的细菌大为减少。
直接检查水中的病原菌是比较困难的，常用测定细菌总数和大肠杆菌菌群数，来判断水的污染程度。目前我国规定生活饮用水的标准为1mL水中细菌总数不超过100个；每1升水中大肠菌群数不超过3个。超过此数，表示水源可能受粪便等污染严重，水中可能有病原菌存在。
3、 水传疾病细菌
凡是能引起人类疾病的细菌，统称为病原菌或致病菌。细菌在人体内寄生、增殖并引起疾病的特性称为细菌的致病性或病原性。如鼠疫细菌引起鼠疫，结核杆菌引起结核。致病性强弱程度以毒力表示，各种细菌的毒力不同，并可因宿主种类及环境条件不同而发生变化。
引发水传疾病的细菌主要有：可以导致伤寒或副伤寒的伤寒沙门氏菌和副伤寒沙门氏菌；导致沙门氏菌病的沙门氏菌；导致细菌性痢疾的志贺氏菌；导致霍乱的霍乱弧菌；导致肠胃炎的肠病原埃希氏大肠菌、小肠结炎耶尔森氏菌和空弯曲杆菌；导致急性呼吸道疾病军团病的嗜肺军团菌；导致结核病的结核分枝杆菌；导致肺病的其他沸点型分枝杆菌。
1946年到1980年，美国因水传播疾病弯曲杆菌的大肠埃希氏菌引发的肠胃炎爆发过7次，发病人数近5000人；志贺氏菌引发的痢疾达61次之多，发病人数1300余人；沙门氏菌引发的沙门氏菌病75次，发病人数达18000余人。
三、 寄生虫引发的疾病
寄生现象是指两种生物在一起生活，其中一方受益，另一方受害，后者给前者提供营养物质和居住场所的生物共生现象。受益的一方称为寄生物，受损害的一方称为宿主。这类过寄生生活的生物统称为寄生物，寄生虫是一种寄生于植物、动物和人的体表或体内以获取营养，赖以生存，并损害宿主的多细胞无脊椎动物或单细胞的原生动物。
1、 寄生虫病
寄生虫病对人体健康的危害十分严重，广大发展中国、特别在特带和亚热带地区，寄生虫依然广泛流行。疟疾、血吸虫病、丝虫病、利什曼病和锥虫病等寄生虫病，严重威胁着儿童和成人的健康甚至生命。在不发达地区，尤其农村的贫苦人群中，多种寄生虫混合感染也是常见的。肠道寄生虫病的发病率已被认为是衡量一个地区经济文化发展的基本指标。
在经济发达国家，寄生虫病也是公共卫生的重要问题。估计美英两国阴道毛滴虫的感染人数有350万。在前苏联，蓝氏贾第鞭毛虫的感染特别严重；许多人兽共患寄生虫病给经济发达地区的畜牧业造成很大损失，也危害人群的健康。此外，如弓形虫病、因孢子虫病、肺孢子虫病等与艾滋病有关的原虫病，在一些经济发达国家，包括日本、荷兰、英国、法国与美国等开始出现流行现象。
我国是寄生虫严重流行的国家之一，特别在广大农村，寄生虫病一直危害人民健康的主要疾病。如疟疾、血吸虫病、丝虫病、黑热病和钩虫病，曾经夺去成千上万人的生命。此外，流行相当广泛的原虫病有：贾第鞭毛虫病、阴道滴虫病、阿米巴病；蠕虫病有：旋毛虫病、华支睾吸虫病、并殖吸虫病、包虫病、带涤虫病和囊虫病等。近几年致病性寄生虫病，如隐孢子虫病、弓形虫病、粪类圆线虫病的病例亦时有报告，且逐渐增加。寄生虫病不仅是我国的一个严重的公共卫生问题，也是实现WHO提出“2000年人人享有卫生保健”的战略目标不可忽视的重要方面。
2、 水传疾病寄生虫
目前已知的水传疾病寄生虫有卡氏棘变形虫，能引发阿米巴脑膜脑炎；结肠肠袋虫，能引发小袋虫病；隐孢子虫，能引发隐孢子虫病；痢疾内变形虫，能引发阿米巴性痢疾；表吮贾第鞭毛虫，能引发贾第鞭毛虫病；福氏纳归虫，能引发原发性阿米巴脑膜脑炎。大多数寄生虫可以在水中存活，并能通过传播，因此还有许多寄生虫间接通过水传播引发各种疾病。1946年到1980年，美国发生的水传寄生虫病48次，发病人数近2万人。
四、 藻类引起的疾病
1、 藻类属性
藻类是能够进行光合作用，能利用光能把无机物合成有机物供自身需要，能独力生活的一类自养原植体植物。藻类是一群古老的植物。化石记录，大约在35～33亿年前，已有和现代藻类相似的有机体存在。从现代藻类的形态、构造、生理等方面，也反映出藻类是一群原始的植物，已知在地球上大约有3万余种藻类。
藻类在形态上千差万别，小的只有几微米，必须在显微镜下才能看到；较大的肉眼可见；最大的体长可达60m以上。尽管藻类种类繁多，但是，它们基本上是没有根、茎、叶分化的原植体植物。藻类在自然界中几乎到处都有发布，主要是生长在水中（淡水或海水）。但在潮湿的岩石上、墙壁和树干上、土壤中也都有它们的水分。在水中生活的藻类，有的浮游于水中，也有的固着于水中岩石上或附着于其他植物体上。
藻类对环境条件要求不高，适应环境能力强，可以在营养贫乏，光照强度微弱的环境中生长。在地震、火山爆发、洪水泛滥后形成的新鲜无机质上，它们是最先的居住者。有些海藻可以在100m深的海底生活，有些藻类能在零下数十度的南北极或终年积雪的高山上生活，有些蓝藻能在高达85摄氏度的温泉中生活，有的藻类能与真菌共生形成地衣。
藻类植物是地区上最重要的初级生产者，它们光合同化生产有机碳的总量约为高等植物的7倍，同时固氮素。因此，藻类不仅是人类和动物极其重要食物源，而且它们光合作用中放出的氧也是大气中氧的最重要的来源。不言而喻，它们对自然生态系统的物质循环及环境质量有着深刻的影响。
由于中国副员辽阔，自然环境复杂多样，使得中国淡水藻类资源也十分丰富而多样。近一个世纪的调查研究表明，淡水藻类中的各个门类在中国都有发现，而且种类都非常丰富。已知全世界藻类植物约有40000种，其中淡水藻类有25000种左右，而中国已发现的（包括已报道的和已鉴定但未报道的）淡水藻类约9000种。
2、 藻类的危害
在正常情况下，水生生态系统中，藻类群落的物种结构保持着良好的多样性状态，即种类多，但每种的个体不多，这种藻类群落发挥出良好的生态效益－保持水质良好状态，且水产丰富。但是当水体受到污染或高度富营养化时，水体内的氮、磷营养元素浓度增高，水体生产力提高，某些特征性藻类（主要为蓝藻、绿藻）异常增殖，使水质恶化，水体衰退，这种现象或过程，称为水质富营养化。此时水面藻类增多，成片成团地覆盖在水体表面，发生在湖面上称为“水华”或“湖靛”，发生在海湾或河口区称为“赤潮”。此时死亡的藻类腐烂，水中溶解氧迅速下降，水体变色发臭，水质恶化，大批鱼类因缺氧或藻毒素中毒出现死亡。中国常见的能形成有害水华的藻类有微囊藻，还有鱼腥藻、项圈藻、颤藻、束丝藻等蓝藻，小定鞭藻的水华已引起多起养殖鱼类的中毒事件；硅藻水华也偶有大面积发生。1991年冬春之父，湖北省汉江发生的约200km范围的硅藻水华，造成很大危害，严重地影响了武汉市和沿江地区的工业生产和居民生活。
藻类对人体健康的危害主要体现在藻毒素上。藻类死亡后毒素进入水中，当毒素达到一定浓度后，直接饮用受到污染的水会引起中毒，轻者引发肠胃炎，重者可以致人死亡。藻毒素也可以通过食物链富集，人们食用水产品后发生中毒。据研究，河豚鱼有毒与藻类毒素有密切关系。
