生物选择器是为了促进快速生长菌（非丝状菌）的生长，抑制慢速生长菌（丝状菌）的生长，而在曝气池的入口处设置的旨在维持较高的底物浓度的一段区域。根据在生物选择器内曝气与否，一般将其分为好氧、缺氧和厌氧三类。
生物选择器的作用在于控制活性污泥法的丝状菌污泥膨胀。其作用机理主要是动力学选择作用和吸收作用。
（1）动力学选择作用
在选择器中底物浓度较高，絮体菌具有较高的生长速率，而进入主曝气区后底物浓度较低，丝状菌生长占优势，因而在整个系统内丝状菌和絮体菌保持一个合理的比例，将会起到控制污泥膨胀的作用。
（2）吸收作用
一般认为絮体菌比丝状菌对底物具有更高的吸收能力，在选择器内高底物浓度条件下，絮体菌吸收了较多的有机物并储存在体内，进入主曝气区后利用这部分有机物继续生长，使絮体菌占优势，从而控制了污泥膨胀。
